{"id":837,"date":"2025-10-20T14:29:38","date_gmt":"2025-10-20T12:29:38","guid":{"rendered":"https:\/\/fiches-especes.simonpotier.fr\/?page_id=837"},"modified":"2026-03-25T18:12:25","modified_gmt":"2026-03-25T17:12:25","slug":"origine-et-construction-des-donnees","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/spes.anivise.fr\/index.php\/origine-et-construction-des-donnees\/","title":{"rendered":"Origine et construction des donn\u00e9es"},"content":{"rendered":"\t\t
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Ce site propose une visualisation enrichie de donn\u00e9es scientifiques issues de bases ouvertes et fiables.
Voici les sources utilis\u00e9es pour chaque type d\u2019information, ainsi que les m\u00e9thodes de construction des donn\u00e9es affich\u00e9es :<\/p>\n

Image de l\u2019esp\u00e8ce<\/strong><\/h3>\n

Les images sont automatiquement r\u00e9cup\u00e9r\u00e9es via l\u2019API de Wikipedia<\/strong>, sur la base du nom scientifique de l\u2019esp\u00e8ce.
Si aucune image n\u2019est trouv\u00e9e, un message d\u2019information est affich\u00e9 \u00e0 la place.<\/p>\n

Nom fran\u00e7ais, nom scientifique, noms \u00e9trangers et classification<\/strong><\/h3>\n

Ces donn\u00e9es sont extraites de la base IOC World Bird List V14.2<\/strong>, une r\u00e9f\u00e9rence taxonomique reconnue \u00e0 l\u2019\u00e9chelle internationale : https:\/\/www.worldbirdnames.org<\/a><\/p>\n

 
<\/a><\/p>\n

CARTES DE DISTRIBUTION<\/strong><\/h3>\n
\n

Les cartes de distribution affich\u00e9es sur ce site ont \u00e9t\u00e9 g\u00e9n\u00e9r\u00e9es \u00e0 partir de deux sources compl\u00e9mentaires selon la disponibilit\u00e9 des donn\u00e9es :<\/p>\n

 <\/strong><\/p>\n

Cartes eBird Status & Trends<\/strong> : lorsque disponibles, les cartes ont \u00e9t\u00e9 g\u00e9n\u00e9r\u00e9es automatiquement gr\u00e2ce au package R {ebirdst}<\/code> en s’appuyant sur les donn\u00e9es d\u2019abondance saisonni\u00e8re fournies par le projet eBird Status and Trends<\/em> (Cornell Lab of Ornithology). Une cl\u00e9 d\u2019acc\u00e8s a \u00e9t\u00e9 obtenue conform\u00e9ment aux conditions d\u2019utilisation d\u2019eBird. Certaines cartes proviennent \u00e9galement de INaturalist (fonds marron). Les cartes r\u00e9sultantes sont issues d\u2019un traitement par raster, lissage et projection, et pr\u00e9sent\u00e9es sous forme d\u2019abondance relative cumul\u00e9e sur l\u2019ann\u00e9e. Les cartes ont \u00e9t\u00e9 stylis\u00e9es avec ggplot2<\/code> et superpos\u00e9es \u00e0 un fond cartographique mondial (Natural Earth) pour une meilleure lisibilit\u00e9. Les donn\u00e9es sont utilis\u00e9es dans le respect des licences et conditions d\u2019attribution des plateformes d\u2019origine, dans un but strictement p\u00e9dagogique et non commercial.<\/p>\n

 
Les cartes ne sont pas disponibles pour l’ensemble des esp\u00e8ces, des nouvelles cartes seront disponibles prochainement. <\/span><\/p>\n

 <\/span><\/p>\n

r\u00e9gion et altitude moyenne<\/strong><\/h3>\n
Les donn\u00e9es ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9cup\u00e9r\u00e9e gr\u00e2ce \u00e0 la base de donn\u00e9es BIRDBASE.<\/span><\/div>\n
 <\/strong><\/div>\n<\/div>\n

Statut UICN (menace & tendance des populations)<\/strong><\/h3>\n

Les donn\u00e9es de conservation proviennent directement du site de l\u2019UICN \u2013 Liste rouge des esp\u00e8ces menac\u00e9es. <\/strong><\/p>\n

Avec le syst\u00e8me de la Liste rouge de l\u2019UICN, chaque esp\u00e8ce ou sous-esp\u00e8ce peut \u00eatre class\u00e9e dans l\u2019une des neuf cat\u00e9gories suivantes : \u00c9<\/span>teinte (EX), \u00c9<\/span>teinte \u00e0 l\u2019\u00e9tat sauvage (EW), En danger critique (CR), En danger (EN), Vuln\u00e9rable (VU), Quasi menac\u00e9e (NT), Pr\u00e9occupation mineure (LC), Donn\u00e9es insuffisantes (DD), Non \u00e9valu\u00e9e (NE). Les donn\u00e9es choisies et affich\u00e9es dans l’interface sont les donn\u00e9es \u00e0 l’\u00e9chelle globale.<\/p>\n

ANNEXES
Les informations ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9cup\u00e9r\u00e9es via le site Species+.<\/span><\/h3>\n

 <\/span><\/span><\/h3>\n

NOMS VERNACULAIRES ET NOMS LATINS<\/strong><\/h3>\n
Ces donn\u00e9es sont extraites de la <\/span>base IOC World Bird List (version 2024)<\/strong>, une r\u00e9f\u00e9rence taxonomique reconnue \u00e0 l\u2019\u00e9chelle internationale.<\/span><\/div>\n
 <\/span><\/div>\n

R\u00e9gime alimentaire & strat\u00e9gies de fourragement<\/strong><\/h3>\n

Ces informations sont issues de la base EltonTraits<\/strong>, qui fournit des estimations normalis\u00e9es du comportement \u00e9cologique des oiseaux. <\/p>\n

Les donn\u00e9es sont pr\u00e9sent\u00e9es sous forme de graphiques circulaires, correspondant \u00e0 :<\/p>\n

 <\/strong><\/h4>\n

Composition du r\u00e9gime alimentaire<\/strong><\/h4>\n

Estimations du pourcentage d\u2019utilisation des cat\u00e9gories suivantes :<\/p>\n

\n
\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n
Cat\u00e9gorie<\/th>\nDescription<\/th>\n<\/tr>\n<\/thead>\n
Invert\u00e9br\u00e9s<\/strong><\/td>\nInsectes, vers, mollusques\u2026<\/td>\n<\/tr>\n
Vert\u00e9br\u00e9s endothermes<\/strong><\/td>\nMammif\u00e8res, oiseaux<\/td>\n<\/tr>\n
Vert\u00e9br\u00e9s ectothermes<\/strong><\/td>\nReptiles, amphibiens<\/td>\n<\/tr>\n
Poissons<\/strong><\/td>\nEsp\u00e8ces aquatiques<\/td>\n<\/tr>\n
Charognes<\/strong><\/td>\nRestes, carcasses, d\u00e9chets<\/td>\n<\/tr>\n
Fruits<\/strong><\/td>\nFruits et drupes<\/td>\n<\/tr>\n
Nectars<\/strong><\/td>\nNectar, pollen, exsudats<\/td>\n<\/tr>\n
Graines<\/strong><\/td>\nGrains, c\u00e9r\u00e9ales, noix<\/td>\n<\/tr>\n
V\u00e9g\u00e9taux<\/strong><\/td>\nFeuilles, herbes, tiges, plantes diverses<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n<\/div>\n<\/div>\n

 <\/strong><\/h4>\n

Strates de fourragement<\/strong><\/h4>\n

Les donn\u00e9es indiquent la proportion d\u2019activit\u00e9 de recherche de nourriture dans les strates suivantes :<\/p>\n

Sous l\u2019eau<\/strong><\/p>\n

Surface de l\u2019eau<\/strong><\/p>\n

Sol<\/strong><\/p>\n

Sous-bois (< 2m)<\/strong><\/p>\n

Hauteur moyenne (2m \u00e0 la canop\u00e9e)<\/strong><\/p>\n

Canop\u00e9e<\/strong><\/p>\n

Dans les airs<\/strong><\/p>\n

Chaque strate re\u00e7oit aussi un score de 0 \u00e0 10, totalisant 10 (soit 100 %), pour repr\u00e9senter les habitudes de l\u2019esp\u00e8ce.<\/p>\n

 <\/a><\/p>\n

M\u00e9thodologie de codage des r\u00e9gimes alimentaires et strategies de fourragement (d\u2019apr\u00e8s Wilman et al., 2014)<\/h3>\n

Dans leur base de donn\u00e9es EltonTraits, Wilman et al. (2014)<\/strong> ont cherch\u00e9 \u00e0 traduire les informations relatives aux r\u00e9gimes alimentaires<\/strong> et aux strates de fourragement<\/strong> en donn\u00e9es aussi quantitatives que possible<\/strong>, \u00e0 partir de descriptions expertes issues de la litt\u00e9rature.<\/p>\n

Les descriptions publi\u00e9es sont rarement exprim\u00e9es de fa\u00e7on chiffr\u00e9e en pourcentages. Cependant, elles sont g\u00e9n\u00e9ralement assez pr\u00e9cises pour permettre une estimation proportionnelle approximative<\/strong>.
Pour cela, les auteurs ont mis en place une standardisation de l\u2019interpr\u00e9tation de certains termes<\/strong> et de leur poids relatif, afin d\u2019assurer une coh\u00e9rence dans toute la base.<\/p>\n

Pour chaque cat\u00e9gorie de nourriture ou de strate de fourragement, une importance relative estim\u00e9e<\/strong> a \u00e9t\u00e9 cod\u00e9e sous forme d\u2019un entier allant de 0 \u00e0 10<\/strong>, chaque unit\u00e9 correspondant \u00e0 un palier de 10 %.
Ainsi, une valeur de 3<\/code> repr\u00e9sente une utilisation estim\u00e9e de 30 %, et la somme de toutes les cat\u00e9gories<\/strong> au sein d\u2019une m\u00eame variable (r\u00e9gime ou strate) totalise 10<\/strong>, soit 100 %.<\/p>\n

Les auteurs ont \u00e9tabli des correspondances entre expressions courantes et scores num\u00e9riques. Par exemple :<\/p>\n

\u00ab Mange principalement des fruits \u00bb \u2192 score de 6 ou plus<\/p>\n

\u00ab Mange parfois des fruits \u00bb \u2192 score de 1 ou 2<\/p>\n

\u00ab Mange occasionnellement des fruits \u00bb \u2192 score d\u2019au plus 1<\/p>\n

Les scores ont \u00e9t\u00e9 ajust\u00e9s en fonction du reste du texte et du contexte<\/strong>.
Lorsque plusieurs types d\u2019aliments ou de strates \u00e9taient list\u00e9s comme importants, les scores individuels ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9duits<\/strong> pour maintenir l\u2019\u00e9quilibre.
Par exemple, si une esp\u00e8ce est d\u00e9crite comme \u00ab mange principalement des fruits et parfois des graines et des feuilles \u00bb, alors les auteurs attribuaient fruit = 6<\/strong>, graines = 2<\/strong>, feuilles = 2<\/strong>.
S\u2019il n\u2019y avait qu\u2019un seul aliment secondaire, les valeurs pouvaient \u00eatre fruit = 8<\/strong> et graines = 2<\/strong>.<\/p>\n

L\u2019analyse comparative de plusieurs sources pour une m\u00eame esp\u00e8ce a montr\u00e9 que les auteurs listent g\u00e9n\u00e9ralement les cat\u00e9gories les plus importantes en premier<\/strong>, suivies des autres par ordre d\u00e9croissant d\u2019importance.
En l\u2019absence de termes comparatifs explicites, Wilman et al. ont attribu\u00e9 plus de poids \u00e0 la premi\u00e8re cat\u00e9gorie mentionn\u00e9e<\/strong>, puis des valeurs d\u00e9gressives pour les suivantes.<\/p>\n

Traits fonctionnels : rythme, habitat, migration, SCOialit\u00e9 et poids<\/strong><\/h3>\n

Ces donn\u00e9es sont crois\u00e9es entre EltonTraits,<\/strong> AVONET et BIRDBASE<\/strong>, selon la disponibilit\u00e9. Pour le poids, la valeur moyenne entre les m\u00e2les et les femelles est affich\u00e9e.<\/p>\n

Long\u00e9vit\u00e9<\/strong><\/h3>\n

Les donn\u00e9es sur la long\u00e9vit\u00e9 proviennent de la base AnAge<\/strong>, d\u00e9velopp\u00e9e par le Human Ageing Genomic Resources<\/strong> :<\/p>\n

\u00c2ge maximum enregistr\u00e9 (en ann\u00e9es, arrondi \u00e0 l’ann\u00e9e sup\u00e9rieure)<\/p>\n

Source de l\u2019information : \u00c9tat naturel<\/strong>, captivit\u00e9<\/strong> ou inconnu.<\/strong><\/p>\n

 <\/strong><\/p>\n

Donn\u00e9es morphologiques<\/strong><\/h3>\n

Ces mesures proviennent exclusivement de la base AVONET.<\/strong><\/p>\n

 
<\/strong><\/p>\n

reproduction<\/strong><\/h3>\n

Ces donn\u00e9es proviennent exclusivement de la base <\/span>BIRDBASE.<\/strong><\/p>\n

 <\/strong><\/p>\n

remarque g\u00e9n\u00e9rale<\/strong><\/h3>\n

Toutes les donn\u00e9es affich\u00e9es sont issues de sources ouvertes ou r\u00e9utilisables avec attribution.
L\u2019objectif est de proposer une interface p\u00e9dagogique<\/strong> pour l\u2019exploration scientifique, sans revendication de propri\u00e9t\u00e9 sur les donn\u00e9es d\u2019origine.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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